本中心自2012年成立，先后设立了“中医健康服务示范与推广”、“重大慢性病疗效攻关”和“技术产品研发与转化”三大协同创新任务。
中医健康服务示范与推广任务，主要依托国家和上海重大项目，以“健康状态辨识关键技术”和“中医健康服务与大数据处理分析”为核心任务，协同开展健康服务应用、健康大数据采集与分析技术、绩效评估与模式探索等研究，构建大数据背景下中医健康服务模式。
重大慢性病疗效攻关任务，主要依托国家中医药行业等重大项目，以“中西医协同重大慢性病疗效攻关”为核心任务，以肺癌等三种重大慢性病为示范病种。
技术产品研发与转化任务，主要依托国家科技支撑计划项目，以开发“中医四诊信息融合关键技术”和“基于互联网的移动医疗终端支持技术”为核心任务，研发健康状态监测与评估、中医特色诊疗、数字化健康服务等产品，创新中医健康服务技术与中药产品。
目前围绕三大任务项目，截至到2020年初，近三年中心共承担50万元以上科研项目22项，经费总额16145.3万元。项目清单如下：
